Der Zweite Weltkrieg
In diesen Jahren wurde das soeben wiederhergestellte Gebäude erneut mehrfach und massiv durch Bombentreffer beschädigt, wodurch insbesondere Dach und Glaskuppel der Aula arg in Mitleidenschaft gezogen wurden.
Von August 1945 bis Oktober 1953 war die Interalliierte (Militär-)Kommandantur in Teilen des Justizpalastes untergebracht. Sie war ein Organ der Alliierten Kommission.
Bis 1970 beherbergte der Justizpalast auch das – seither im gegenüber liegenden Palais Trautson in der Neustiftgasse untergebrachte – Bundesministerium für Justiz.